查询结果:   李自臣,史新宇,禹龙,田生伟,王梅.基于深度信念网络的CYP450 2C9抑制性分类[J].计算机应用与软件,2019,36(2):189 - 193,210.
中文标题
基于深度信念网络的CYP450 2C9抑制性分类
发表栏目
人工智能与识别
摘要点击数
44
英文标题
CLASSIFICATION OF CYP450 2C9 INHIBITORS BASED ON DEEP BELIEF NETWORK
作 者
李自臣 史新宇 禹龙 田生伟 王梅 Li Zichen Shi Xinyu Yu Long Tian Shengwei Wang Mei
作者单位
乌鲁木齐职业大学信息工程学院 新疆 乌鲁木齐 830002 新疆大学软件学院 新疆 乌鲁木齐 830008 新疆大学网络中心 新疆 乌鲁木齐 830046 新疆医科大学药学院 新疆 乌鲁木齐 830011  
英文单位
School of Information Engineering, Urumqi Vocational University, Urumqi 830002, Xinjiang, China School of Software, Xinjiang University, Urumqi 830008, Xinjiang, China Network Center, Xinjiang University, Urumqi 830046, Xinjiang, China College of Pharmacy, Xinjiang Medical Unversity, Urumqi 830011, Xinjiang, China  
关键词
深度学习 CYP450 2C9 分子指纹 深度信念网络 支持向量机
Keywords
Deep learning CYP450 2C9 Molecular fingerprint Deep belief network Support vector machine
基金项目
国家自然科学基金项目(31160341);高等职业技术教育研究会项目(GZYLX2016018)
作者资料
李自臣,高工,主研领域:机器学习。史新宇,硕士生。禹龙,教授。田生伟,教授。王梅,博士。李莉,副教授。 。
文章摘要
细胞色素P450 2C9 (Cytochrome P450 2C9)是人体肝脏中重要的代谢酶,参与多种药物代谢,约占CYP450蛋白总量的15%~20%。利用深度学习思想,提出基于深度信念网络DBN(Deep Belief Network)的CYP450 2C9抑制性分类模型。实验选用13 000个化合物作为数据集,采用PubChem和MACCS分子指纹进行分子结构表征。利用DBN的半监督学习方式从预处理后的特征中学习更本质的特征表示,避免人工提取特征的过程,实现CYP450 2C9的抑制性分类。实验结果表明:在同等条件下,DBN相比于SVM和ANN具有明显优势,平均分类准确率为80.6%,灵敏度(SE)为86.9%,特异性(SP)为66.2%,对药物筛选和新药研发具有积极意义。
Abstract
The cytochrome P450 2C9 is one of the important metabolic enzymes in the human liver, which involves in many kinds of drug metabolism and accounts for about 15%~20% of the total CYP450 protein. Deep learning was adopted to propose a CYP450 2C9 inhibitory classification model based on deep belief network (DBN). In the experiment, 13 000 compounds were selected as data sets. PubChem and MACCS molecular fingerprints were used to characterize the molecular structure. We used DBN semi-supervised learning method to learn more essential feature representation from the features obtained by pre-processing, thus avoiding the process of extracting features manually and realizing classification of CYP450 2C9 inhibitors. Experimental results show that DBN has outstanding advantages compared with SVM and ANN at the same conditions. The average accuracy is 80.6%, the sensitivity (SE) is 86.9% and the specificity (SP) is 66.2%. It has a positive significance in drug screening and development. 
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2015
12
150
[摘要]
137
有向无环图-双支持向量机的多类分类方法
牛犇
人工智能与识别
2015
11
167
[摘要]
138
航空发动机转子故障诊断系统设计与实现
张俊红
嵌入式软件与应用
2015
11
217
[摘要]
139
基于核PCA与在线支持向量机的电子鼻气体分类研究
余炜
算法
2015
11
269
[摘要]
140
基于改进SVM和HMM的文本信息抽取算法
孙师尧
算法
2015
11
281
[摘要]
141
人工鱼群算法优化支持向量机的无线传感器网络节点定位
谭军
网络与通信
2015
10
144
[摘要]
142
融合拓扑特征和领域特征的非精确图匹配算法
李智杰
人工智能与识别
2015
10
164
[摘要]
143
基于边缘对称性和IULBP的行人检测方法
张敏霞
图像处理与应用
2015
10
216
[摘要]
144
改进布谷鸟搜索算法优化SVM的网络流量预测模型
路璐
网络与通信
2015
1
124
[摘要]
145
改进ABC算法优化LSSVM的网络流量预测模型
许爱军
信息技术交流
2015
1
323
[摘要]
146
基于PSO-SVM的孤立性肺结节良恶性分类研究
马言博
应用技术与研究
2014
9
50
[摘要]
147
支持向量机修正ARIMA误差的微博热点预测
蒋玉婷
人工智能与识别
2014
9
187
[摘要]
148
一种基于颜色不变量和PHOG特征的交通标志检测方法
周广波
人工智能与识别
2014
8
160
[摘要]
149
基于Gabor特征融合和LSSVM的人脸识别算法
薛涛
人工智能与识别
2014
7
191
[摘要]
150
基于数据挖掘降雨量建模和预测方法研究
李爱武
应用技术与研究
2014
6
55
[摘要]
151
基于脉象信号处理的肝硬化诊断方法研究
宫树杰
应用技术与研究
2014
6
69
[摘要]
152
基于邻域分布局部线性嵌入的粗集支持向量机
刘立群
算法
2014
6
264
[摘要]
153
一种基于关联规则与支持向量机的基因表达数据分类模型
王美华
人工智能与识别
2014
5
155
[摘要]
154
基于层次K-均值聚类的支持向量机模型
王秀华
人工智能与识别
2014
5
172
[摘要]
155
融合K-均值聚类、FNN、SVM的网络入侵检测模型
邬斌亮
安全技术
2014
5
312
[摘要]
156
基于支持向量机的中文文本蕴涵识别研究
李妍
应用技术与研究
2014
4
51
[摘要]
157
大鱼际掌纹特征提取与识别算法研究
郑云云
人工智能与识别
2014
4
165
[摘要]
158
在康复理疗系统中基于人体部位的多人检测跟踪方法
李海军
人工智能与识别
2014
4
173
[摘要]
159
一种改进的深度神经网络在小图像分类中的应用研究
吕刚
人工智能与识别
2014
4
182
[摘要]
160
基于PSO优化SVM的纹理图像分割
陈云凤
图像处理与应用
2014
4
214
[摘要]
161
布谷鸟算法优化支持向量机的网络热点话题预测
戴臻
信息技术交流
2014
4
330
[摘要]
162
遗传算法同步选择特征和支持向量机参数的网络入侵检测
李学峰
安全技术
2014
3
301
[摘要]
163
基于动态特性的实时视频烟雾检测
何大超
图像处理与应用
2014
2
201
[摘要]
164
基于灰色支持向量机的网络舆情预测模型
曾振东
算法
2014
2
300
[摘要]
165
基于改进流形学习的数据分类算法
关健生
数据工程
2014
12
60
[摘要]
166
基于多特征融合和SVM分类器的植物病虫害检测方法
蒋龙泉
多媒体技术应用
2014
12
186
[摘要]
167
基于特征融合的核量化图像分类方法
刘越
多媒体技术应用
2014
12
198
[摘要]
168
基于Contourlet-NMF和SVM的近红外人脸识别方法
曾梦璐
人工智能与识别
2014
12
229
[摘要]
169
一种改进的基于支持向量机的多类分类方法
赵亮
人工智能与识别
2014
12
233
[摘要]
170
非线性筛选因子和加权的体育成绩建模与预测
刘昊
应用技术与研究
2014
11
105
[摘要]
171
一种基于KPCA-LSSVM的可用带宽在线预测算法
戴冬
网络与通信
2014
10
116
[摘要]
172
变异粒子群优化最小二乘支持向量机的网络流量预测
嵇可可
网络与通信
2014
10
129
[摘要]
173
基于均匀设计优化预测模型参数的混沌时间序列预测
陈海英
人工智能与识别
2014
10
176
[摘要]
174
特征融合和支持向量机反馈的图像检索算法
罗益荣
图像处理与应用
2014
10
209
[摘要]
175
集成PCA降维与分类算法的垃圾网页检测
李法良
算法
2014
10
269
[摘要]
176
基于惩罚的SVM和集成学习的非平衡数据分类算法研究
刘进军
人工智能与识别
2014
1
186
[摘要]
177
基于校准DCT特征的JPEG图像隐写分析
关俊波
图像处理与应用
2014
1
229
[摘要]
178
基于ADE算法的LSSVM在混沌时间序列中的应用
崔庆
算法
2014
1
275
[摘要]